Classificação
Os cogumelos podem ser divididos na generalidade em três grupos, de acordo com a sua forma de vida: os Micorrízicos (ou Simbióticos), os Sapróbios (ou Saprófitos ou Saprobiontes) e os Parasitas.
Os primeiros vivem em simbiose mutualista com as árvores e plantas que os rodeiam, produzindo micorrizas que os interligam às raízes das mesmas, ajudando-as no seu desenvolvimento, facilitando e conduzindo até estas água e nutrientes químicos, e protegendo-as inclusive de ataques patogénicos. Em troca os fungos recebem das raízes das árvores e plantas sobretudo hidratos de carbono, que eles próprios não podem produzir (é de relembrar que os fungos não efectuam fotossíntese).
Os Sapróbios (que vivem em saprobiose, ou seja que se desenvolvem e nutrem de matéria orgânica em decomposição) que são extremamente importantes graças à sua acção decompositora e que assim processam e eliminam a matéria morta, libertando e devolvendo novamente os seus elementos constituintes ao solo e assim permitindo o inicio de um novo ciclo de vida.
E os Parasitas que extraem, como o seu próprio nome indica, de um hóspede vivo, os nutrientes que necessitam ao seu desenvolvimento. Possuem hifas especializadas (haustórios) que perfuram as células das plantas e digerem as substâncias do seu interior.
Existem ainda fungos que são insectívoros e helmintívoros (que se alimentam de vermes, especialmente nemátodos). Os primeiros libertam à sua volta substâncias pegajosas à sua volta, onde os insectos ficam presos, sendo posteriormente digeridos por exoenzimas. Os segundos libertam substâncias tranquilizantes que imobilizam os pequenos vermes, procedendo depois à sua assimilação.
Os cogumelos, na sua forma mais comum (mas de modo nenhum a única), são normalmente constituídos por um chapéu e um pé. O chapéu alberga o himénio (superfície onde são produzidos os esporos) geralmente na sua parte inferior, e que pode ser formado por lâminas, por tubos que são visualizados à superfície como poros, por pregas ou ainda por agulhas, ou então noutros casos a revestir alvéolos ou até encarcerado no interior do próprio corpo frutífero (nesta caso denominado de gleba). O pé pode ou não possuir um anel e/ou uma volva (porção residual do véu universal que envolve, como se se tratasse de um saco, o cogumelo numa fase inicial do seu desenvolvimento).
As formas do chapéu, o tipo de superfície e a margem do mesmo, são elementos fundamentais na ajuda da identificação e classificação dos cogumelos.
A estes elementos juntam-se os tipos de himénio e o seu modo de inserção no pé. Este também é classificado quanto à sua forma e aspecto da superfície, bem como dos seus eventuais anéis e volva.
A título de exemplo apontam-se algumas das designações mais utilizadas nesta classificação:
Chapéu
Forma: plano, convexo, hemisférico, campanulado, ovóide, deprimido, afunilado, umbonado, umbilicado ou excêntrico,…
Superfície: lisa, venada, pubescente, fibrilhosa, zonada, reticulada, escamosa, pontilhada ou viscosa,…
Margem: lisa, estriada, canelada, crenada, crenulada, sulcada, fendida, ondulada, lobulada, franjada, involuta ou revoluta,…
Himénio
Forma das Lâminas: estreitas, largas, ascendentes, convexas, onduladas ou arqueadas,…
Modo de inserção no pé: adnadas, adnexas, distantes, livres, dentadas, decorrentes,…
Pé
Forma: adelgaçado, bulboso, cilíndrico, claviforme, fusiforme, delgado, dilatado, obeso, flexuoso, radicante,…
Superfície: fibrosa, estriada, rugosa, pulverulenta, zonada, ponteada, escrobilada,…
Anel: Simples, simples descendente, duplo, armilado, livre,…
Volva: constrita, aderente, circuncisa, emarginada, concêntrica, escamosa, em forma de saco, marginada,…
Outra das características importantes na avaliação da identificação é ainda a cor dos esporos (ou esporada) dos mesmos, e a forma destes (normalmente visível por análise microscópica).
Muitas vezes são ainda necessários ensaios químicos laboratoriais e, em casos mais complexos, ainda o recurso à execução de testes de sequenciação de ADN, estando actualmente a ser esta uma das razões pela qual se tem vindo a observar a actual revisão de uma forma mais ou menos geral, da sua classificação, com a alteração das famílias onde tinham sido anteriormente agrupados, e do “parentesco” existente entre alguns fungos ou cogumelos.